Íslenska Kristskirkjan er lútherskur söfnuður og því er kenningargrundvöllur hans í aðalatriðum sá sami og þjóðkirkjunnar. Auk þess vill söfnuðurinn tileinka sér áherslur frumkirkjunnar m.t.t. náðargjafa Heilags anda og annarra þátta sem stuðluðu að miklum árangri kristinnar kirkju á fyrstu öldum e. Kr. Þetta kemur fram í meiri sveigjanleika í starfsaðferðum og helgihaldi.